1) Caso ao emitir NFE mostre a msg: Duplicidade de NF-e, com diferenca na chave de acesso, é porque já foi emitida NFE com este número.
2) Pesquise em pedido de cliente o nr de NFE. Caso não encontre é porque foi incluso em algum pedido o nr de nfe, clicou em emitir nfe, mas não aguardou atualizar no sistema a emissão e o pedido de cliente foi alterado/deletado.
3) Copie o nr da chave que aparece na msg e consulte na Receita: https://www.nfe.fazenda.gov.br/portal/consulta.aspx?tipoConsulta=completa&tipoConteudo=XbSeqxE8pl8=
4) Para ver no sistema o histórico do que ocorreu acesse: Relatórios->Administrativo->Movimentação do estoque em pedidos.
No campo Nota informe o nr da NFE.
5) Caso deseje atualizar no sistema a NFE, crie em pedido de cliente o pedido e gentileza nos enviar o arquivo xml.